针对员工恶意仲裁单位能否起诉的问题，根据法律规定，单位确实可以起诉。但在此之前，员工必须先申请劳动仲裁。劳动仲裁是诉讼前的必经程序，这是为了确保争议的公正解决。若员工认为公司行为侵犯其权益，可在调解无果后依法申请劳动仲裁，对仲裁结果不满再向法院提起诉讼。
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员工针对恶意仲裁行为，可先与单位进行协商，协商无果后可申请劳动仲裁维权。若仲裁结果不能令人满意，员工有权向法院提起诉讼。这是一个包含协商、仲裁和诉讼的完整流程，旨在确保员工的权益得到妥善保护。
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关于员工恶意仲裁单位能否起诉的问题，答案是可以的。员工首先应通过投诉劳动监察来解决问题，如果无效，可以选择申请支付令或劳动仲裁。若仲裁结果不公，可以进一步提起民事诉讼。在整个过程中，单位也可能会被要求支付相应的赔偿金，以确保双方的权益得到平衡和保护。